Эта статья дает некоторое представление о том как рассчитывается температура плавления ДНК. Для молекулярной биологии, особенно для таких процессов, как ПЦР, секвенирование или создание микрочипов, важно, определить температуру плавления ДНК, или Tm. Эта температура определяется как температура в градусах Цельсия, при которой 50% от всех молекул последовательности ДНК гибридизуются в двойные нити, и 50% присутствуют в виде одиночных нитей.

ТАК ПЛАВИТСЯ ДНК

Плавление днк в этом случае не является изменением агрегатного состояния, а просто представляет собой диссоциацию двух молекул двойной спирали ДНК. Если гомогенный раствор одинаковых двухцепочечных молекул ДНК нагревают, нити диссоциируют при более высоких температурах. В приведенном выше примере Tm будет 60 ° С

.Так выглядит расплавленная ДНК при t=72° C

Обратите внимание, что процесс гибридизации ДНК и диссоциации является сложным и высокодинамичным. В Tm, двойные цепи постоянно образуются и разбиваются, и каждая молекулы ДНК принимает участие в большом количестве взаимодействий с течением времени.

Температура плавления коррелирует с тем, как легко двухцепочечной ДНК комплекс образуется. Это, в свою очередь, зависит от вероятности каждой пары нуклеотидов в облигации. Процесс гибридизации совместных, уже сформированных пары нуклеотидов, помогает помочь соединить соседние нуклеотиды в пары.