Днк топоизомераза Днк топоизомераза

Первый фермента тип топоизомераза (Topo II) был выделен из E.coli. Topo ферменты II обладают способностью вырезать обе нити молекулы двухцепочечной ДНК, пройти очередную порцию дуплекса через разрез, и запечатать сокращение процесса, который использует АТФ. В зависимости от субстратной ДНК, эти маневры будут иметь эффект изменения положительной суперспирали в отрицательную суперспираль или для увеличения количества отрицательных супервитков.

Предположительно такой активности не требуется уэукариот, так как связывание гистонов увеличивает потенциальную нагрузку. Все топоизомеразы II типа катализируют катенацию и декатенацию, то есть связывание и отсоединение, двух различных дуплексов ДНК.

ДНК-гиразы состоит из двух идентичных субъединиц. Гидролиз АТФ-гиразы в присущей АТФазе, вносящей конформационные изменения, которые имеют решающее значение для функционирования фермента. Функции ферментов способны ввести отрицательные супервитки в ДНК-матрице. Как отмечалось ранее, DnaA может инициировать репликацию только на отрицательном суперспиральном шаблона. Измерения степени сверхспирализации ДНК в E.coli, предполагают, что есть одна отрицательный суперспираль для каждых 15 — 20 витков спирали ДНК. Второй ключевой функцией гиразы является удаление положительных супервитков.